Το νέο εκλογικό σύστημα ανάδειξης Σ.Δ. αποτελεί ένα δαιδαλώδες και εξαιρετικά πολύπλοκο σύστημα, που έφερε στο τραπέζι νέους όρους, όπως αυτόν της ταξινομικής ψήφου και του εκλογικού μέτρου. Υπήρξαν πολλές αντιδρασεις και έντονη κριτική που έχει ασκηθεί και σε νομικό επίπεδο, αφού δεν είναι λίγοι αυτοί που θεωρούν ότι η εν λόγω διαδικασία ανάδειξης των οργάνων διοίκησης των ΑΕΙ καταστρατηγεί βασικές αρχές του Συντάγματος.
Σημειώνεται πως με το σύστημα αυτό και με τον ζυγό αριθμό των εσωτερικών μελών δεν αποκλείονται οι ισοψηφίες, γεγονός που βραχυκυκλώνει τις όποιες εξελίξεις.
Χαρακτηριστικές είναι οι περιπτώσεις των Πανεπιστημίων Μακεδονίας, Αιγαίου και Θεσσαλίας όπου εδώ και πολλούς μήνες δεν μπορούν να συσταθούν τα Σ.Δ. διότι η απαίτηση της αυξημένης συναίνεσης μεταξύ των έξι εσωτερικών μελών δεν μπορεί να επιτευχθεί.
Σημειώνεται πως με το σύστημα αυτό και με τον ζυγό αριθμό των εσωτερικών μελών δεν αποκλείονται οι ισοψηφίες, γεγονός που βραχυκυκλώνει τις όποιες εξελίξεις.
Χαρακτηριστικές είναι οι περιπτώσεις των Πανεπιστημίων Μακεδονίας, Αιγαίου και Θεσσαλίας όπου εδώ και πολλούς μήνες δεν μπορούν να συσταθούν τα Σ.Δ. διότι η απαίτηση της αυξημένης συναίνεσης μεταξύ των έξι εσωτερικών μελών δεν μπορεί να επιτευχθεί.
Καθημερινή: Πρέπει να επανεξεταστεί
Ανάμεσα στις αντιδράσεις περιλαμβάνεται και αυτή της εφημερίδας «Καθημερινή» που ζητάει
να επανεξεταστεί το νέο σύστημα ανάδειξης των πρυτανικών αρχών, αδειάζοντας έτσι την υπουργό παιδείας Νίκη Κεραμέως.«Το νέο σύστημα ανάδειξης των πρυτανικών αρχών, που τώρα άρχισε να δοκιμάζεται στην πράξη, φαίνεται ότι δικαιώνει κάποιες από τις επιφυλάξεις των επικριτών του» γράφει η «Καθημερινή» και το προχωράει ακόμη πιο κάτω:
«Αν αποδειχθεί ότι η πολυπλοκότητά του οδηγεί σε βραχυκύκλωμα τη διοίκηση των ιδρυμάτων, θα πρέπει να επανεξεταστεί, σε συνεννόηση με την πανεπιστημιακή κοινότητα. Προτεραιότητα είναι να λειτουργούν με διαφάνεια και αποτελεσματικότητα τα πανεπιστήμια».